当前银行业由于实施营改增在信息技术系统改造、业务与税务配合衔接、流程改造等方面的困难及影响。

　　1、实施信息技术系统改造方面：银行业的确面临着比其他行业更高的改造成本，因为银行业涉及的系统改造范围广泛，只要涉及收入类的系统，包括利息收入、中间业务收入、同业收入等系统都要改造，银行业信息技术的大量采用无疑要求大量的硬件和软件投资，尤其是营改增后，需要进一步完善的功能应用还有很多，软件环境需要不断的升级。

　　2、实现业务与税务配合衔接方面：营改增后银行必须建立增值税开票系统与现有各业务系统的有效衔接，解决在衔接过程中出现的硬件、软件等问题，同时还需要制订相应的增值税开票流程，规范工作人员业务行为，防范风险。银行现有税务方面的人才匮乏，更重视的是业务及信贷能手，今后"营改增"实施过程中肯定需要税务方面的专职人员，人员的岗前培训和新增岗位人工成本也是较大的支出。

　　3、流程改造方面：营改增后，银行业从税制设计及征管到银行科技系统和业务流程诸多方面都需改造。如果按照5月1日营改增落地的要求来看，最大挑战是细则没有出台，并由此导致政策的不确定与改革成本不可逆两者的矛盾。但如果坐等政策出台，可能无法及时完成营改增实施工作，给业务、客户带来巨大影响，因此商业银行只能依靠掌握的信息，结合增值税的基本原理摸索前行，可一旦政策出台有较大变动，就很可能造成一部分成本沉没。