《财政部、国家税务总局关于农业生产资料征免增值税政策的通知》规定，批发和零售的种子、种苗、化肥、农药、农机免征增值税。因此，农机只能在批零环节免征增值税，而生产环节不能享受免税。该集团成立了专门的农机销售公司，将价值链进行分割，由农机生产厂将农机卖给农机销售公司，销售公司对外销售给农机给经销商或客户，这样从生产环节到批发环节的增值额免税，直接降低了整个集团的增值税税负。

　　农机生产公司与农机销售公司之间的产品定价对增值税税负有明显的影响，但并不是农机销售公司的增值额越大，企业增值税税负越低。合理定价需要考虑两个因素，一是不能恶意转移定价，税务机关有权核定销售额，从而导致罚款，增加税收负担。二是根据增值税暂行条例的规定，纳税人销售或者进口饲料、化肥、农药、农机、农膜等货物，税率为13%。也就是说，销售农机适用13%的税率。《国家税务总局关于印发〈增值税部分货物征税范围注释〉的通知》第十六条规定，农机零部件不属于本货物的征收范围。农机配件不属于农机范围，不适用13%的税率，因而农机生产企业购进农机配件的税率为17%。只有当农机产品中取得增值税进项抵扣发票的物耗率（比）≦76.47%（1×13%÷17%）时，农机生产企业才会出现应缴增值税的情形。目前来说，农机销售毛利率较低，刻意压低生产环节销售价格，极易出现增值税留抵，对企业来说，进项税现金流流出无法得到弥补，影响企业的正常生产经营。调整农机生产企业的产品结构，提高17%税率产品收入在全部产品收入中的比例，能有效消化农机生产企业的进项留抵税额。

　　此外，还要考虑企业所得税的影响。农机化技术是一项综合性强、涵盖面广的复杂工程技术，不仅涉及农业装备科技进步，也与生物、工程、信息、环境技术等密切相关。农机企业集团要想发展有后劲，必须有大量研发投入，农机生产公司完全可以具备申报高新技术企业的条件，从而享受高新技术企业15%的企业所得税优惠税率，而由于农机销售公司是不可能进行生产研发的，只能按照25%的税率纳税，如果将大额利润转移到农机销售公司，虽然农机批发环节增值额免征增值税，但由于税率差，会引起企业所得税税负上升。